稻谷種在催芽中出現啞谷、發涎、燒芽、芽根不齊等異常現象。其實出現上述狀況多為管理不善引起，只要找到原因，并及時采取合理補救措施，就可減少損失，培育壯秧。

1.啞谷多。啞谷率一般應不超過5%為正常。啞谷多的原因主要是種子質量差；或浸種時間不足造成吸水不夠；或破胸時溫度低，翻拌不均，致使破胸不齊。因此，必須精選谷種，充分浸種，進行高溫破胸。

2.發涎和酒精中毒。催芽時谷堆水分過多，溫度不夠，時間拉得太長，造成氧氣嚴重不足，種子進行無氧呼吸，產生酒精中毒；同時谷殼起涎沾手，嚴重時生霉變質。因此，催芽時應注意保溫，防止淋水過多，已經產生沾涎的稻種，可及時放在30度左右溫水中淘洗干凈，重新上堆催芽。

3.高溫燒芽。這主要是破胸高峰期，谷堆溫度過高、通氣不良，谷種進行無氧呼吸，引起酒精積累中毒，故一般在高溫燒芽的同時，常伴有酒精中毒，因此在催芽中必須經常檢查谷堆溫度，溫度超過　30°c　時應及時翻堆散溫通氣，谷種產生輕微酒精中毒，可清洗后繼續催芽。

4.根芽不齊。在催芽過程中，常因催芽技術不當，出現“有根無芽”或“有芽無根”的現象，其根源是沒有掌控好水、氣、溫的關系所致。只要遵循“干長根，濕長芽”和“冷長根，熱長芽”的規律，調控好水分、溫度的關系，就可解決根芽不齊的現象。