鰻魚的土腥味與其它淡水養殖魚類相似，其成因主要是由于養殖水體中的藻類如顫藻、魚腥藻等和細菌中的放線菌在生長繁殖過程中產生的化學物質釋放溶解于水中，滲入鰻魚肌肉內，導致鰻魚產生特異的土腥味。

土池養鰻，利用藻類維持池水的生態環境，消耗水體的有機物及一些對鰻魚有害的化學物質，減少換水量，這有助于鰻魚的正常生長。但藻類在適宜的水溫條件及豐富的有機物含量的環境中將迅速繁殖生長，產生大量的化學物質。池底淤泥、鰻魚產生的大量糞便分泌物及散失的殘餌為藻類繁殖生長提供了良好的營養條件，在水溫較高的季節，藻類大量繁殖，即使加大換水量也難以控制藻類數量的穩定性。土池及大面積的精養池存在適合藻類及放線菌生長繁殖所需的條件，由藻類等產生引起鰻魚土腥味的化學物質長期于養殖水體中保持一定濃度，生產出的鰻魚易產生土腥味，尤其在7-10月份的高溫期。

養殖生產中如何有效地預防鰻魚產生土腥味呢？控制池底底質，降低池底淤泥的含量，降低養殖過程中水體有機物的來源是關鍵。在一個養殖周期結束后，應干池曝曬池底，并將池底淤泥清理出養殖池。養殖過程中應控制水體有機物含量；選擇有機物含量少的水源；加大換水量；定期使用水質改良劑如生石灰、沸石粉及離子交換和絡合劑、氧化劑等；而使用微生態制劑，在穩定藻相，培養水色，抑制放線菌、顫藻和魚腥藻等的生長繁殖上有獨到之處。它還能利用其分子活性基團很強的選擇性離子交換能力，達到調節和改善底質之功效。定期使用微生態制劑既能免去因大量換水而消毒、魚食量下降等諸多麻煩和不便，經濟又快捷，能從根本上消除土腥味的產生。

已具有土腥味的鰻魚經清潔水流水吊養處理后可去除土腥味，同時配合使用海藻精等可達到改善肉質和消除土腥味之雙重效果。總之，定期使用微生態制劑調控水質和在飼料中添加海藻精才能有效地預防土腥味的產生。